上海海洋水族馆位于浦东陆家嘴金融贸易中心，毗邻著名的东方明珠塔、金茂大厦、明珠公园、滨江大道、陆家嘴美食城，北临黄浦江，与繁华的浦西外滩隔江相望；南连筹建中的浦东高层带建筑群；东接规划保留会展中心。将会构成浦东地区旅游、购物、观光的黄金区域，成为上海地区极富特色的旅游景点。
区域分隔
主楼各层具体分布为：
第一层：设有大厅、售票处、礼品店及餐厅；
参观游客由第一层入口乘自动扶梯直达第三层开始游览水族馆
第三层：设有贵宾大厅（设在金字塔之中）、科普教室、瀑布、小溪、7个展示池，分为亚洲、南美洲、澳洲三大展区。
游客参观了第三层后通过自动扶梯下到第二层。
第二层： 设有20个展示池及企鹅展示中心，分为澳洲、非洲、冷水、南极、海水五大展区。
游客参观第二层后直接乘自动扶梯下到地下二层。
地下二层： 水族馆主体，深海展区。
游客进入一条自动步行隧道后，穿过体积达650立方米的大屏幕水景展示缸和海底隧道，最后由隧道出口回到第一层的礼品中心及餐厅，完成整个参观的旅程。
游客可按如下路线进行参观：
参观游客由第一层入口乘自动扶梯直达第三层开始游览水族馆
游客参观了第三层后通过自动扶梯下到第二层。
游客参观第二层后直接乘自动扶梯下到地下二层。
游客进入一条自动步行隧道后，穿过体积达650立方米的大屏幕水景展示缸和海底隧道，最后由隧道出口回到第一层的礼品中心及餐厅，完成整个参观的旅程。
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